Protein–RNA interactions for Protein: Q15119

PDK2, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK2Q15119 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDK2Q15119 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDK2Q15119 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDK2Q15119 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDK2Q15119 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDK2Q15119 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDK2Q15119 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDK2Q15119 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDK2Q15119 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDK2Q15119 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PDK2Q15119 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDK2Q15119 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDK2Q15119 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDK2Q15119 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDK2Q15119 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDK2Q15119 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDK2Q15119 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDK2Q15119 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDK2Q15119 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDK2Q15119 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDK2Q15119 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PDK2Q15119 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDK2Q15119 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PDK2Q15119 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDK2Q15119 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDK2Q15119 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDK2Q15119 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDK2Q15119 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDK2Q15119 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDK2Q15119 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PDK2Q15119 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDK2Q15119 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PDK2Q15119 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDK2Q15119 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDK2Q15119 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDK2Q15119 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDK2Q15119 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDK2Q15119 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDK2Q15119 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDK2Q15119 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDK2Q15119 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDK2Q15119 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDK2Q15119 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDK2Q15119 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDK2Q15119 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK2Q15119 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK2Q15119 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK2Q15119 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK2Q15119 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK2Q15119 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK2Q15119 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK2Q15119 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK2Q15119 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK2Q15119 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK2Q15119 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK2Q15119 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK2Q15119 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK2Q15119 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK2Q15119 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK2Q15119 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK2Q15119 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK2Q15119 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK2Q15119 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK2Q15119 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK2Q15119 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK2Q15119 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK2Q15119 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK2Q15119 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDK2Q15119 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDK2Q15119 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDK2Q15119 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDK2Q15119 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDK2Q15119 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDK2Q15119 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDK2Q15119 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDK2Q15119 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDK2Q15119 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDK2Q15119 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDK2Q15119 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDK2Q15119 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDK2Q15119 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDK2Q15119 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDK2Q15119 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDK2Q15119 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDK2Q15119 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PDK2Q15119 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDK2Q15119 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDK2Q15119 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDK2Q15119 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PDK2Q15119 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PDK2Q15119 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDK2Q15119 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDK2Q15119 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDK2Q15119 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDK2Q15119 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PDK2Q15119 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PDK2Q15119 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDK2Q15119 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDK2Q15119 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDK2Q15119 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms