Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms