Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
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