Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CNGB1Q14028 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms