Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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PDE6HQ13956 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDE6HQ13956 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDE6HQ13956 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDE6HQ13956 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDE6HQ13956 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDE6HQ13956 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDE6HQ13956 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDE6HQ13956 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDE6HQ13956 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDE6HQ13956 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDE6HQ13956 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDE6HQ13956 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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PDE6HQ13956 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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PDE6HQ13956 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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PDE6HQ13956 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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PDE6HQ13956 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE6HQ13956 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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PDE6HQ13956 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE6HQ13956 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE6HQ13956 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE6HQ13956 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE6HQ13956 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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