Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2H2Q13888 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2H2Q13888 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2H2Q13888 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2H2Q13888 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2H2Q13888 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2H2Q13888 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2H2Q13888 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2H2Q13888 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2H2Q13888 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2H2Q13888 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2H2Q13888 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2H2Q13888 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2H2Q13888 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2H2Q13888 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2H2Q13888 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2H2Q13888 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2H2Q13888 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2H2Q13888 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms