Protein–RNA interactions for Protein: Q13642

FHL1, Four and a half LIM domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL1Q13642 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FHL1Q13642 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FHL1Q13642 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FHL1Q13642 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FHL1Q13642 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FHL1Q13642 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FHL1Q13642 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FHL1Q13642 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms