Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HTR4Q13639 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HTR4Q13639 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HTR4Q13639 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HTR4Q13639 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HTR4Q13639 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HTR4Q13639 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HTR4Q13639 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HTR4Q13639 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HTR4Q13639 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HTR4Q13639 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HTR4Q13639 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HTR4Q13639 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HTR4Q13639 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HTR4Q13639 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HTR4Q13639 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HTR4Q13639 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HTR4Q13639 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HTR4Q13639 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HTR4Q13639 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HTR4Q13639 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HTR4Q13639 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HTR4Q13639 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HTR4Q13639 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HTR4Q13639 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HTR4Q13639 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HTR4Q13639 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HTR4Q13639 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HTR4Q13639 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HTR4Q13639 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HTR4Q13639 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HTR4Q13639 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HTR4Q13639 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HTR4Q13639 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HTR4Q13639 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HTR4Q13639 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HTR4Q13639 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HTR4Q13639 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HTR4Q13639 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HTR4Q13639 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HTR4Q13639 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HTR4Q13639 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HTR4Q13639 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HTR4Q13639 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HTR4Q13639 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HTR4Q13639 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HTR4Q13639 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HTR4Q13639 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HTR4Q13639 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HTR4Q13639 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HTR4Q13639 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HTR4Q13639 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HTR4Q13639 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HTR4Q13639 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HTR4Q13639 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HTR4Q13639 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HTR4Q13639 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HTR4Q13639 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HTR4Q13639 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HTR4Q13639 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HTR4Q13639 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HTR4Q13639 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HTR4Q13639 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HTR4Q13639 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HTR4Q13639 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HTR4Q13639 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HTR4Q13639 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HTR4Q13639 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HTR4Q13639 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTR4Q13639 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTR4Q13639 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTR4Q13639 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTR4Q13639 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTR4Q13639 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HTR4Q13639 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTR4Q13639 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTR4Q13639 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTR4Q13639 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTR4Q13639 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTR4Q13639 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTR4Q13639 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTR4Q13639 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTR4Q13639 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTR4Q13639 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTR4Q13639 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTR4Q13639 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTR4Q13639 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTR4Q13639 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTR4Q13639 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTR4Q13639 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HTR4Q13639 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HTR4Q13639 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HTR4Q13639 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HTR4Q13639 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HTR4Q13639 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HTR4Q13639 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HTR4Q13639 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HTR4Q13639 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HTR4Q13639 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HTR4Q13639 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms