Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
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