Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
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