Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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