Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA3FQ13275 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
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