Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
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