Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NPRL3Q12980 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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