Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCAPQ12770 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms