Protein–RNA interactions for Protein: Q12748

CTF3, Inner kinetochore subunit CTF3, yeastyeast

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Length 733 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTF3Q12748 TDA2YER071C 381 nt2.87□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 TCD1YHR003C 1290 nt2.87□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.87□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.87□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.87□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.87□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.87□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.87□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt2.87□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 YKR033CYKR033C 426 nt2.87□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 ATP18YML081C-A 180 nt2.87□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 RPL16BYNL069C 597 nt2.87□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 ATX1YNL259C 222 nt2.87□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 NGL1YOL042W 1092 nt2.87□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 YDR179W-AYDR179W-A 1392 nt2.87□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 YPL150WYPL150W 2706 nt2.86□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 RIM13YMR154C 2184 nt2.86□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 RVS161YCR009C 798 nt2.86□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt2.86□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 snR70snR70 164 nt2.86□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 FIN1YDR130C 876 nt2.86□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 FAR7YFR008W 666 nt2.86□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 SYS1YJL004C 612 nt2.86□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 CPR7YJR032W 1182 nt2.86□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 ILM1YJR118C 612 nt2.86□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 PHD1YKL043W 1101 nt2.86□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 JIP3YLR331C 378 nt2.86□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 RUF22RUF22 515 nt2.86□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 YPR177CYPR177C 372 nt2.86□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 NET1YJL076W 3570 nt2.86□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 NEL1YHR035W 1893 nt2.86□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 BIT61YJL058C 1632 nt2.86□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 SNQ2YDR011W 4506 nt2.85□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 GIS4YML006C 2325 nt2.85□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 YFL019CYFL019C 354 nt2.85□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 RSR1YGR152C 819 nt2.85□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 YIL054WYIL054W 318 nt2.85□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 VPS63YLR261C 327 nt2.85□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 NTC20YBR188C 423 nt2.85□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 ERG11YHR007C 1593 nt2.85□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 AFR1YDR085C 1863 nt2.85□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 ARK1YNL020C 1917 nt2.85□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 SOK1YDR006C 2706 nt2.84□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt2.84□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt2.84□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 YGR228WYGR228W 345 nt2.84□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 PCL5YHR071W 690 nt2.84□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 YIL029CYIL029C 429 nt2.84□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 UBX4YMR067C 1251 nt2.84□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 YBL065WYBL065W 345 nt2.84□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 YNL150WYNL150W 408 nt2.84□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 MBA1YBR185C 837 nt2.84□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 SLP1YOR154W 1764 nt2.84□□□□□ -1.96
CTF3Q12748 VHR1YIL056W 1923 nt2.83□□□□□ -1.96
CTF3Q12748 CDC55YGL190C 1581 nt2.83□□□□□ -1.96
CTF3Q12748 SRB4YER022W 2064 nt2.83□□□□□ -1.96
CTF3Q12748 YDL187CYDL187C 330 nt2.83□□□□□ -1.96
CTF3Q12748 YLR257WYLR257W 966 nt2.83□□□□□ -1.96
CTF3Q12748 RRG8YPR116W 834 nt2.83□□□□□ -1.96
CTF3Q12748 MAL33YBR297W 1407 nt2.83□□□□□ -1.96
CTF3Q12748 YCR001WYCR001W 315 nt2.82□□□□□ -1.96
CTF3Q12748 APC11YDL008W 498 nt2.82□□□□□ -1.96
CTF3Q12748 YDR115WYDR115W 318 nt2.82□□□□□ -1.96
CTF3Q12748 ERG28YER044C 447 nt2.82□□□□□ -1.96
CTF3Q12748 RPL11BYGR085C 525 nt2.82□□□□□ -1.96
CTF3Q12748 SCEIQ0160 708 nt2.82□□□□□ -1.96
CTF3Q12748 RPF1YHR088W 888 nt2.82□□□□□ -1.96
CTF3Q12748 BET4YJL031C 984 nt2.82□□□□□ -1.96
CTF3Q12748 YJR157WYJR157W 363 nt2.82□□□□□ -1.96
CTF3Q12748 RPS16AYMR143W 432 nt2.82□□□□□ -1.96
CTF3Q12748 SWS2YNL081C 432 nt2.82□□□□□ -1.96
CTF3Q12748 CSI2YOL007C 1026 nt2.82□□□□□ -1.96
CTF3Q12748 SPC29YPL124W 762 nt2.82□□□□□ -1.96
CTF3Q12748 RPL11AYPR102C 525 nt2.82□□□□□ -1.96
CTF3Q12748 snR43snR43 209 nt2.82□□□□□ -1.96
CTF3Q12748 AYT1YLL063C 1425 nt2.82□□□□□ -1.96
CTF3Q12748 AI2Q0055 2565 nt2.82□□□□□ -1.96
CTF3Q12748 DBF20YPR111W 1695 nt2.82□□□□□ -1.96
CTF3Q12748 POM152YMR129W 4014 nt2.82□□□□□ -1.96
CTF3Q12748 SLN1YIL147C 3663 nt2.81□□□□□ -1.96
CTF3Q12748 ATG13YPR185W 2217 nt2.81□□□□□ -1.96
CTF3Q12748 DYN1YKR054C 12279 nt2.81□□□□□ -1.96
CTF3Q12748 MIC19YFR011C 513 nt2.81□□□□□ -1.96
CTF3Q12748 CIC1YHR052W 1131 nt2.81□□□□□ -1.96
CTF3Q12748 YIL068W-AYIL068W-A 384 nt2.81□□□□□ -1.96
CTF3Q12748 EAF6YJR082C 342 nt2.81□□□□□ -1.96
CTF3Q12748 YKL202WYKL202W 582 nt2.81□□□□□ -1.96
CTF3Q12748 RRT1YBL048W 312 nt2.81□□□□□ -1.96
CTF3Q12748 YNL122CYNL122C 348 nt2.81□□□□□ -1.96
CTF3Q12748 RPN3YER021W 1572 nt2.81□□□□□ -1.96
CTF3Q12748 CEP3YMR168C 1827 nt2.81□□□□□ -1.96
CTF3Q12748 UBP14YBR058C 2346 nt2.81□□□□□ -1.96
CTF3Q12748 STI1YOR027W 1770 nt2.8□□□□□ -1.96
CTF3Q12748 SHS1YDL225W 1656 nt2.8□□□□□ -1.96
CTF3Q12748 TIM11YDR322C-A 291 nt2.8□□□□□ -1.96
CTF3Q12748 YIL012WYIL012W 342 nt2.8□□□□□ -1.96
CTF3Q12748 YMR144WYMR144W 1029 nt2.8□□□□□ -1.96
CTF3Q12748 AIM36YMR157C 768 nt2.8□□□□□ -1.96
CTF3Q12748 HSP10YOR020C 321 nt2.8□□□□□ -1.96
CTF3Q12748 IKI3YLR384C 4050 nt2.8□□□□□ -1.96
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