Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC27■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC27■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
LMOD3Q0VAK6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms