Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms