Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms