Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms