Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE4BQ07343 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms