Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms