Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CTDSPL2Q05D32 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms