Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms