Protein–RNA interactions for Protein: Q05513

PRKCZ, Protein kinase C zeta type, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZQ05513 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms