Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms