Protein–RNA interactions for Protein: Q04048

SYF1, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, yeast

Predicted RBP Predictions only

Length 859 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	Q04048	YDR042C	YDR042C	603 nt		2.97	□□□□□ -1.93
SYF1	Q04048	YIP5	YGL161C	933 nt		2.97	□□□□□ -1.93
SYF1	Q04048	YJL133C-A	YJL133C-A	225 nt		2.97	□□□□□ -1.93
SYF1	Q04048	RRT16	YNL105W	429 nt		2.97	□□□□□ -1.93
SYF1	Q04048	ATP11	YNL315C	957 nt		2.97	□□□□□ -1.93
SYF1	Q04048	CUR1	YPR158W	759 nt		2.97	□□□□□ -1.93
SYF1	Q04048	INP52	YNL106C	3552 nt		2.97	□□□□□ -1.93
SYF1	Q04048	RIF1	YBR275C	5751 nt		2.97	□□□□□ -1.93
SYF1	Q04048	YEL1	YBL060W	2064 nt		2.96	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	SSN2	YDR443C	4263 nt		2.96	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	ESL2	YKR096W	3588 nt		2.96	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	SNA4	YDL123W	423 nt		2.96	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	VTC1	YER072W	390 nt		2.96	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	AIM19	YIL087C	474 nt		2.96	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	VPS63	YLR261C	327 nt		2.96	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	APL5	YPL195W	2799 nt		2.96	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	RTT10	YPL183C	3042 nt		2.95	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	HPA3	YEL066W	540 nt		2.95	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	NTF2	YER009W	378 nt		2.95	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	YKL123W	YKL123W	381 nt		2.95	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	YLL044W	YLL044W	447 nt		2.95	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	YLR230W	YLR230W	306 nt		2.95	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	YCL002C	YCL002C	792 nt		2.95	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	SSP1	YHR184W	1716 nt		2.95	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	BNA4	YBL098W	1383 nt		2.95	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	SSY1	YDR160W	2559 nt		2.94	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	AAD16	YFL057C	459 nt		2.94	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	YHR054C	YHR054C	1065 nt		2.94	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	RPS22A	YJL190C	393 nt		2.94	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	CAP1	YKL007W	807 nt		2.94	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	MRP49	YKL167C	414 nt		2.94	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	YPT52	YKR014C	705 nt		2.94	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	ERG29	YMR134W	714 nt		2.94	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	SRL4	YPL033C	846 nt		2.94	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	AFT2	YPL202C	1251 nt		2.94	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	YCL007C	YCL007C	393 nt		2.94	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	APC2	YLR127C	2562 nt		2.94	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	TRM2	YKR056W	1920 nt		2.93	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	DUG2	YBR281C	2637 nt		2.93	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	UTP14	YML093W	2700 nt		2.93	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	SHS1	YDL225W	1656 nt		2.93	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	REV3	YPL167C	4515 nt		2.93	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	UBC5	YDR059C	447 nt		2.93	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	YMR31	YFR049W	372 nt		2.93	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	YOR152C	YOR152C	771 nt		2.93	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	YBR063C	YBR063C	1215 nt		2.93	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	ADF1	YCL058W-A	342 nt		2.93	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	MOT1	YPL082C	5604 nt		2.93	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	CWC22	YGR278W	1734 nt		2.93	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	KIN82	YCR091W	2163 nt		2.93	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	PCK1	YKR097W	1650 nt		2.92	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	ADY4	YLR227C	1482 nt		2.92	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	YHR086W-A	YHR086W-A	162 nt		2.92	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	YIL068W-A	YIL068W-A	384 nt		2.92	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	YIL156W-B	YIL156W-B	222 nt		2.92	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	CPR7	YJR032W	1182 nt		2.92	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	BET3	YKR068C	582 nt		2.92	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	KTI11	YBL071W-A	249 nt		2.92	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	YBR062C	YBR062C	543 nt		2.92	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	NUP170	YBL079W	4509 nt		2.92	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	YDR098C-B	YDR098C-B	5268 nt		2.92	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	YDR210C-D	YDR210C-D	5268 nt		2.92	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	YDR316W-B	YDR316W-B	5268 nt		2.92	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	YDR365W-B	YDR365W-B	5268 nt		2.92	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	YER138C	YER138C	5268 nt		2.92	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	YER160C	YER160C	5268 nt		2.92	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	YGR038C-B	YGR038C-B	5268 nt		2.92	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	YGR161C-D	YGR161C-D	5268 nt		2.92	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	YJR027W	YJR027W	5268 nt		2.92	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	YLR157C-B	YLR157C-B	5268 nt		2.92	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	YML039W	YML039W	5268 nt		2.92	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	YML045W	YML045W	5268 nt		2.92	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	YMR050C	YMR050C	5268 nt		2.92	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	YOL103W-B	YOL103W-B	5268 nt		2.92	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	YBR012W-B	YBR012W-B	5271 nt		2.92	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	YOR142W-B	YOR142W-B	5268 nt		2.92	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	YPL257W-B	YPL257W-B	5268 nt		2.92	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	YPR158W-B	YPR158W-B	5271 nt		2.92	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	TMN3	YER113C	2121 nt		2.92	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	YFL002W-B	YFL002W-B	1317 nt		2.92	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	YGR161W-A	YGR161W-A	1317 nt		2.92	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	YBL100W-A	YBL100W-A	1317 nt		2.92	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	YCL020W	YCL020W	1317 nt		2.92	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	ICR1	ICR1	3199 nt		2.92	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	TMA64	YDR117C	1698 nt		2.92	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	YER091C-A	YER091C-A	222 nt		2.91	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	YER107W-A	YER107W-A	321 nt		2.91	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	YET1	YKL065C	621 nt		2.91	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	YNR025C	YNR025C	360 nt		2.91	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	HEM4	YOR278W	828 nt		2.91	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	DGK1	YOR311C	873 nt		2.91	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	PHO91	YNR013C	2685 nt		2.91	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	SAP1	YER047C	2694 nt		2.9	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	YLR278C	YLR278C	4026 nt		2.9	□□□□□ -1.94
SYF1	Q04048	FUS1	YCL027W	1539 nt		2.9	□□□□□ -1.95
SYF1	Q04048	VHR1	YIL056W	1923 nt		2.9	□□□□□ -1.95
SYF1	Q04048	FIN1	YDR130C	876 nt		2.9	□□□□□ -1.95
SYF1	Q04048	YFR009W-A	YFR009W-A	258 nt		2.9	□□□□□ -1.95
SYF1	Q04048	SDS22	YKL193C	1017 nt		2.9	□□□□□ -1.95
SYF1	Q04048	YBR051W	YBR051W	351 nt		2.9	□□□□□ -1.95

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