Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC25A11Q02978 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC25A11Q02978 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC25A11Q02978 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC25A11Q02978 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC25A11Q02978 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC25A11Q02978 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC25A11Q02978 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC25A11Q02978 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC25A11Q02978 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC25A11Q02978 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC25A11Q02978 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC25A11Q02978 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC25A11Q02978 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC25A11Q02978 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC25A11Q02978 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC25A11Q02978 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC25A11Q02978 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC25A11Q02978 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC25A11Q02978 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC25A11Q02978 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms