Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms