Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
XPCQ01831 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
XPCQ01831 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
XPCQ01831 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
XPCQ01831 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
XPCQ01831 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
XPCQ01831 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
XPCQ01831 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
XPCQ01831 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
XPCQ01831 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
XPCQ01831 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
XPCQ01831 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
XPCQ01831 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
XPCQ01831 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
XPCQ01831 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
XPCQ01831 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
XPCQ01831 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
XPCQ01831 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
XPCQ01831 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
XPCQ01831 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
XPCQ01831 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
XPCQ01831 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
XPCQ01831 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
XPCQ01831 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
XPCQ01831 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
XPCQ01831 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
XPCQ01831 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
XPCQ01831 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
XPCQ01831 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
XPCQ01831 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
XPCQ01831 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
XPCQ01831 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
XPCQ01831 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
XPCQ01831 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
XPCQ01831 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
XPCQ01831 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
XPCQ01831 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
XPCQ01831 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
XPCQ01831 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
XPCQ01831 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
XPCQ01831 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
XPCQ01831 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
XPCQ01831 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
XPCQ01831 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
XPCQ01831 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
XPCQ01831 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
XPCQ01831 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
XPCQ01831 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
XPCQ01831 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
XPCQ01831 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
XPCQ01831 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
XPCQ01831 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
XPCQ01831 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
XPCQ01831 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
XPCQ01831 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
XPCQ01831 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
XPCQ01831 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
XPCQ01831 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
XPCQ01831 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
XPCQ01831 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
XPCQ01831 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
XPCQ01831 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
XPCQ01831 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
XPCQ01831 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
XPCQ01831 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
XPCQ01831 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
XPCQ01831 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
XPCQ01831 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
XPCQ01831 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
XPCQ01831 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
XPCQ01831 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
XPCQ01831 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
XPCQ01831 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
XPCQ01831 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
XPCQ01831 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
XPCQ01831 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
XPCQ01831 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
XPCQ01831 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
XPCQ01831 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
XPCQ01831 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
XPCQ01831 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
XPCQ01831 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
XPCQ01831 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
XPCQ01831 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
XPCQ01831 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
XPCQ01831 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
XPCQ01831 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
XPCQ01831 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
XPCQ01831 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
XPCQ01831 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
XPCQ01831 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
XPCQ01831 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
XPCQ01831 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
XPCQ01831 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
XPCQ01831 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
XPCQ01831 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
XPCQ01831 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
XPCQ01831 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
XPCQ01831 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
XPCQ01831 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms