Protein–RNA interactions for Protein: Q01415

GALK2, N-acetylgalactosamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALK2Q01415 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GALK2Q01415 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GALK2Q01415 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GALK2Q01415 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GALK2Q01415 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GALK2Q01415 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GALK2Q01415 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GALK2Q01415 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GALK2Q01415 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GALK2Q01415 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GALK2Q01415 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GALK2Q01415 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GALK2Q01415 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GALK2Q01415 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GALK2Q01415 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GALK2Q01415 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GALK2Q01415 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GALK2Q01415 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GALK2Q01415 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GALK2Q01415 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GALK2Q01415 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GALK2Q01415 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GALK2Q01415 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GALK2Q01415 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GALK2Q01415 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GALK2Q01415 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GALK2Q01415 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GALK2Q01415 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GALK2Q01415 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GALK2Q01415 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GALK2Q01415 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GALK2Q01415 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GALK2Q01415 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GALK2Q01415 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GALK2Q01415 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GALK2Q01415 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GALK2Q01415 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GALK2Q01415 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GALK2Q01415 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GALK2Q01415 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GALK2Q01415 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GALK2Q01415 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GALK2Q01415 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GALK2Q01415 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GALK2Q01415 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GALK2Q01415 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GALK2Q01415 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GALK2Q01415 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GALK2Q01415 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GALK2Q01415 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GALK2Q01415 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GALK2Q01415 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GALK2Q01415 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GALK2Q01415 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GALK2Q01415 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GALK2Q01415 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GALK2Q01415 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GALK2Q01415 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GALK2Q01415 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GALK2Q01415 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GALK2Q01415 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GALK2Q01415 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GALK2Q01415 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GALK2Q01415 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GALK2Q01415 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GALK2Q01415 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GALK2Q01415 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GALK2Q01415 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GALK2Q01415 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GALK2Q01415 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GALK2Q01415 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GALK2Q01415 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GALK2Q01415 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GALK2Q01415 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GALK2Q01415 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GALK2Q01415 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GALK2Q01415 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GALK2Q01415 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GALK2Q01415 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GALK2Q01415 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GALK2Q01415 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GALK2Q01415 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GALK2Q01415 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GALK2Q01415 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GALK2Q01415 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GALK2Q01415 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GALK2Q01415 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GALK2Q01415 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GALK2Q01415 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GALK2Q01415 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GALK2Q01415 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GALK2Q01415 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GALK2Q01415 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GALK2Q01415 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GALK2Q01415 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GALK2Q01415 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GALK2Q01415 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GALK2Q01415 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GALK2Q01415 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GALK2Q01415 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms