Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPTBN1Q01082 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms