Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms