Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms