Protein–RNA interactions for Protein: P82980

RBP5, Retinol-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP5P82980 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBP5P82980 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBP5P82980 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RBP5P82980 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBP5P82980 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBP5P82980 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBP5P82980 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RBP5P82980 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBP5P82980 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBP5P82980 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBP5P82980 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBP5P82980 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RBP5P82980 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RBP5P82980 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBP5P82980 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBP5P82980 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBP5P82980 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBP5P82980 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBP5P82980 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBP5P82980 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RBP5P82980 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBP5P82980 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBP5P82980 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBP5P82980 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBP5P82980 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBP5P82980 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBP5P82980 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBP5P82980 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBP5P82980 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBP5P82980 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBP5P82980 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBP5P82980 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBP5P82980 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBP5P82980 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBP5P82980 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBP5P82980 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBP5P82980 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBP5P82980 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBP5P82980 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBP5P82980 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBP5P82980 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBP5P82980 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBP5P82980 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBP5P82980 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBP5P82980 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBP5P82980 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RBP5P82980 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBP5P82980 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBP5P82980 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBP5P82980 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBP5P82980 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBP5P82980 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBP5P82980 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBP5P82980 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBP5P82980 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBP5P82980 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RBP5P82980 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RBP5P82980 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBP5P82980 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBP5P82980 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBP5P82980 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBP5P82980 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBP5P82980 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBP5P82980 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBP5P82980 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RBP5P82980 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RBP5P82980 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBP5P82980 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RBP5P82980 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBP5P82980 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBP5P82980 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBP5P82980 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBP5P82980 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RBP5P82980 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBP5P82980 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBP5P82980 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBP5P82980 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBP5P82980 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBP5P82980 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBP5P82980 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBP5P82980 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBP5P82980 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBP5P82980 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBP5P82980 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBP5P82980 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBP5P82980 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBP5P82980 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBP5P82980 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBP5P82980 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBP5P82980 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBP5P82980 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBP5P82980 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBP5P82980 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBP5P82980 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBP5P82980 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBP5P82980 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBP5P82980 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBP5P82980 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBP5P82980 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBP5P82980 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms