Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms