Protein–RNA interactions for Protein: P62745

RHOB, Rho-related GTP-binding protein RhoB, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBP62745 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHOBP62745 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHOBP62745 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHOBP62745 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHOBP62745 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHOBP62745 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHOBP62745 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHOBP62745 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHOBP62745 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHOBP62745 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHOBP62745 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHOBP62745 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHOBP62745 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOBP62745 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOBP62745 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOBP62745 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOBP62745 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOBP62745 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOBP62745 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOBP62745 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOBP62745 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOBP62745 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOBP62745 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOBP62745 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOBP62745 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOBP62745 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOBP62745 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOBP62745 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOBP62745 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOBP62745 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOBP62745 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RHOBP62745 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RHOBP62745 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RHOBP62745 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RHOBP62745 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RHOBP62745 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOBP62745 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOBP62745 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOBP62745 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOBP62745 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOBP62745 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOBP62745 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOBP62745 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOBP62745 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOBP62745 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOBP62745 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOBP62745 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOBP62745 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOBP62745 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOBP62745 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOBP62745 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOBP62745 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOBP62745 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOBP62745 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOBP62745 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOBP62745 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOBP62745 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOBP62745 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOBP62745 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOBP62745 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOBP62745 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOBP62745 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOBP62745 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOBP62745 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOBP62745 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOBP62745 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOBP62745 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOBP62745 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOBP62745 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOBP62745 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOBP62745 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOBP62745 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOBP62745 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOBP62745 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOBP62745 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOBP62745 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOBP62745 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOBP62745 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOBP62745 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOBP62745 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOBP62745 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOBP62745 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOBP62745 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOBP62745 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOBP62745 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOBP62745 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOBP62745 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOBP62745 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOBP62745 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOBP62745 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOBP62745 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOBP62745 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOBP62745 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOBP62745 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOBP62745 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOBP62745 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOBP62745 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOBP62745 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOBP62745 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOBP62745 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms