Protein–RNA interactions for Protein: P62256

UBE2H, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 H, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2HP62256 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms