Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms