Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ERVFC1P60507 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms