Protein–RNA interactions for Protein: P60174

TPI1, Triosephosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPI1P60174 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPI1P60174 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPI1P60174 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPI1P60174 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPI1P60174 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPI1P60174 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TPI1P60174 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPI1P60174 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPI1P60174 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TPI1P60174 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPI1P60174 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPI1P60174 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPI1P60174 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPI1P60174 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPI1P60174 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPI1P60174 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPI1P60174 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPI1P60174 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TPI1P60174 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPI1P60174 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPI1P60174 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPI1P60174 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPI1P60174 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPI1P60174 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TPI1P60174 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPI1P60174 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPI1P60174 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPI1P60174 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TPI1P60174 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPI1P60174 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPI1P60174 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPI1P60174 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPI1P60174 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPI1P60174 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPI1P60174 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPI1P60174 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPI1P60174 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPI1P60174 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPI1P60174 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPI1P60174 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPI1P60174 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPI1P60174 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPI1P60174 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TPI1P60174 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPI1P60174 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPI1P60174 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TPI1P60174 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPI1P60174 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPI1P60174 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TPI1P60174 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPI1P60174 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPI1P60174 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPI1P60174 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPI1P60174 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPI1P60174 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPI1P60174 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPI1P60174 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPI1P60174 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPI1P60174 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TPI1P60174 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPI1P60174 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPI1P60174 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TPI1P60174 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPI1P60174 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPI1P60174 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPI1P60174 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPI1P60174 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPI1P60174 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPI1P60174 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPI1P60174 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPI1P60174 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPI1P60174 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPI1P60174 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPI1P60174 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPI1P60174 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPI1P60174 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPI1P60174 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPI1P60174 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPI1P60174 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPI1P60174 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPI1P60174 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPI1P60174 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPI1P60174 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TPI1P60174 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TPI1P60174 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPI1P60174 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPI1P60174 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TPI1P60174 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.33■■□□□ 1
TPI1P60174 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TPI1P60174 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TPI1P60174 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TPI1P60174 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPI1P60174 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPI1P60174 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPI1P60174 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TPI1P60174 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TPI1P60174 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TPI1P60174 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPI1P60174 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPI1P60174 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms