Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms