Protein–RNA interactions for Protein: P56377

AP1S2, AP-1 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S2P56377 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AP1S2P56377 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
AP1S2P56377 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
AP1S2P56377 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
AP1S2P56377 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
AP1S2P56377 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
AP1S2P56377 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP1S2P56377 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP1S2P56377 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP1S2P56377 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP1S2P56377 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP1S2P56377 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP1S2P56377 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP1S2P56377 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms