Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP9P55211 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP9P55211 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP9P55211 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP9P55211 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP9P55211 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP9P55211 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP9P55211 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP9P55211 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP9P55211 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP9P55211 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP9P55211 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP9P55211 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP9P55211 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP9P55211 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP9P55211 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP9P55211 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP9P55211 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP9P55211 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP9P55211 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP9P55211 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP9P55211 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP9P55211 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP9P55211 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP9P55211 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP9P55211 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP9P55211 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP9P55211 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP9P55211 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP9P55211 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP9P55211 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP9P55211 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP9P55211 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP9P55211 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP9P55211 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP9P55211 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP9P55211 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP9P55211 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP9P55211 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP9P55211 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP9P55211 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP9P55211 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP9P55211 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP9P55211 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP9P55211 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP9P55211 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CASP9P55211 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CASP9P55211 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CASP9P55211 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CASP9P55211 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CASP9P55211 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CASP9P55211 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CASP9P55211 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CASP9P55211 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CASP9P55211 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CASP9P55211 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CASP9P55211 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CASP9P55211 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CASP9P55211 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CASP9P55211 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CASP9P55211 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CASP9P55211 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CASP9P55211 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CASP9P55211 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CASP9P55211 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CASP9P55211 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CASP9P55211 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CASP9P55211 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CASP9P55211 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CASP9P55211 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CASP9P55211 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CASP9P55211 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CASP9P55211 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CASP9P55211 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CASP9P55211 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CASP9P55211 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CASP9P55211 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CASP9P55211 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CASP9P55211 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CASP9P55211 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CASP9P55211 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CASP9P55211 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CASP9P55211 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CASP9P55211 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CASP9P55211 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CASP9P55211 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CASP9P55211 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CASP9P55211 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CASP9P55211 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CASP9P55211 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CASP9P55211 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CASP9P55211 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CASP9P55211 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CASP9P55211 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CASP9P55211 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CASP9P55211 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CASP9P55211 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CASP9P55211 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CASP9P55211 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CASP9P55211 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms