Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRPF1P55201 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms