Protein–RNA interactions for Protein: P54849

EMP1, Epithelial membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP1P54849 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMP1P54849 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMP1P54849 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMP1P54849 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMP1P54849 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMP1P54849 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMP1P54849 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMP1P54849 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMP1P54849 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMP1P54849 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMP1P54849 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMP1P54849 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMP1P54849 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMP1P54849 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMP1P54849 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMP1P54849 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMP1P54849 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMP1P54849 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMP1P54849 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMP1P54849 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMP1P54849 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EMP1P54849 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EMP1P54849 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMP1P54849 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMP1P54849 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMP1P54849 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMP1P54849 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMP1P54849 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMP1P54849 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMP1P54849 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMP1P54849 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMP1P54849 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMP1P54849 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMP1P54849 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMP1P54849 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMP1P54849 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMP1P54849 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMP1P54849 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMP1P54849 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMP1P54849 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMP1P54849 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMP1P54849 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMP1P54849 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMP1P54849 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMP1P54849 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMP1P54849 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EMP1P54849 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMP1P54849 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMP1P54849 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMP1P54849 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMP1P54849 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMP1P54849 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMP1P54849 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMP1P54849 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMP1P54849 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMP1P54849 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMP1P54849 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMP1P54849 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMP1P54849 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMP1P54849 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMP1P54849 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMP1P54849 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMP1P54849 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EMP1P54849 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EMP1P54849 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EMP1P54849 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EMP1P54849 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EMP1P54849 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EMP1P54849 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EMP1P54849 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMP1P54849 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMP1P54849 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMP1P54849 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMP1P54849 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMP1P54849 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMP1P54849 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMP1P54849 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMP1P54849 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMP1P54849 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMP1P54849 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMP1P54849 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMP1P54849 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMP1P54849 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMP1P54849 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMP1P54849 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMP1P54849 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMP1P54849 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMP1P54849 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMP1P54849 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMP1P54849 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMP1P54849 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMP1P54849 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMP1P54849 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMP1P54849 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMP1P54849 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMP1P54849 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMP1P54849 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMP1P54849 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMP1P54849 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMP1P54849 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms