Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms