Protein–RNA interactions for Protein: P54136

RARS, Arginine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARSP54136 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RARSP54136 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RARSP54136 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RARSP54136 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RARSP54136 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RARSP54136 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RARSP54136 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RARSP54136 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RARSP54136 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RARSP54136 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RARSP54136 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RARSP54136 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
RARSP54136 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
RARSP54136 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RARSP54136 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RARSP54136 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
RARSP54136 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
RARSP54136 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RARSP54136 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RARSP54136 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RARSP54136 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RARSP54136 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RARSP54136 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RARSP54136 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RARSP54136 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
RARSP54136 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RARSP54136 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RARSP54136 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RARSP54136 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RARSP54136 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RARSP54136 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RARSP54136 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RARSP54136 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RARSP54136 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RARSP54136 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RARSP54136 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RARSP54136 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RARSP54136 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RARSP54136 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RARSP54136 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RARSP54136 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RARSP54136 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RARSP54136 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RARSP54136 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RARSP54136 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RARSP54136 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RARSP54136 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RARSP54136 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RARSP54136 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RARSP54136 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RARSP54136 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
RARSP54136 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
RARSP54136 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RARSP54136 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RARSP54136 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RARSP54136 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RARSP54136 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RARSP54136 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RARSP54136 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RARSP54136 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RARSP54136 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RARSP54136 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RARSP54136 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RARSP54136 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RARSP54136 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RARSP54136 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RARSP54136 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RARSP54136 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RARSP54136 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RARSP54136 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RARSP54136 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RARSP54136 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RARSP54136 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RARSP54136 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RARSP54136 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RARSP54136 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RARSP54136 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RARSP54136 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RARSP54136 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RARSP54136 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RARSP54136 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
RARSP54136 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
RARSP54136 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
RARSP54136 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RARSP54136 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RARSP54136 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RARSP54136 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RARSP54136 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RARSP54136 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RARSP54136 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RARSP54136 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RARSP54136 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RARSP54136 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RARSP54136 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RARSP54136 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RARSP54136 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RARSP54136 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RARSP54136 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RARSP54136 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RARSP54136 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms