Protein–RNA interactions for Protein: P51170

SCNN1G, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1GP51170 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms