Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms